Оглавление
Введение.
Глава 1. Первичный анализ регуляции генов.
1.1. Основные понятия и определения.
1.2. Создание базы знаний о факторах и предсказание сайтов связывания.
1.3. Обработка экспериментальных данных и предсказание регулирующих факторов Глава 2. Модель регуляторного комплекса.
2.1. Постановка задачи
2.2. Построение модели
2.2.1. Конструирование и анализ алгоритма оконного класса моделей
2.2.2. Конструирование булева класса моделей.
2.3. Целевая функция
2.4. Поиск оптимального комплекса.
2.4.1. Выбор эффективного алгоритма поиска.
2.4.2. Операторы создания и мутации
2.4.3. Оператор кроссовера.
2.5. Обобщнный класс моделей унификация знаний о сайтах и факторах
2.5.1. Общая структура.
2.5.2. Подкомплекс семантика и структура
2.5.3. Вес обобщнного комплекса.
2.5.4. Эффективная программная реализация математической модели обобщенного комплекса
2.5.5. Операторы создания, мутации и кроссовера в обобщнном классе
2.6. Обобщнная целевая функция.
2.6.1. Компоненты целевой функции
2.6.2. Ограничения обобщнной целевой функции
Глава 3. Взаимодействие с пользователем и оценка качества
3.1. Вычисление комплекса и вывод результата.
3.2. Методы оценки качества результата.
3.2.1. Мультизапуск проверка устойчивости поведения генетического алгоритма
3.2.2. Запуск с кластеризацией
3.2.3. Запуск с расщеплением выборки достоверность результата и переобучение .
3.3. Значимость компонентов подкомплекса.
Глава 4. Реализация и тестирование.
4.1. Реапизация СМЛ
4.2. Тестирование СМА
4.2.1. Тестирование на искусственных данных.
4.2.2. Тестирование на экспериментальных данных.
4.3. Система ЕхР1аш
Заключение.
Список литературы
- Київ+380960830922