ОГЛАВЛЕНИЕ
ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ
Актуальность темы
Цели работы
Методы исследования
Научная новизна
Основные результаты
Практическая значимость работы
Апробация работы
Публикации
Структура и объем работы
ВВЕДЕНИЕ
0.1 Обзор алгоритмических результатов, относящихся к
диссертационному исследованию
0.2 Обзор результатов по регуляции экспрессии генов у хлоропластов и бактерий
0 3 Обзор результатов по моделированию кинетики образования вторичной структуры РНК
ГЛАВА 1. Алгоритм поиска клики в многодольном графе
1.1. Алгоритм поиска клики в случае двух вершин в каждой доле и
доказательство корректности его работы за полиномиальное время
1 2 Алгоритм решения неявно заданной системы однородных линейных уравнений над конечным бимодулем и нижняя оценка
числа клик
1 3. Алгоритм поиска клики в многодольном графе в общем случае и поиск консервативных участков в невыравненном наборе последовательностей на основе этого алгоритма, учет дерева видов 1 4. Тестирование алгоритма
1.5. Вспомогательные программы для выделения лидерных областей
генов и поиска спиралей и слов специального вида по их параметрам в аннотированных геномах
ГЛАВА 2. Предсказание структур РНК, регулирующих
экспрессию генов, у хлоропластов и бактерий на основе алгоритма поиска клики
2 1. Регуляция трансляции посредством взаимодействия белков с
РНК для различных генов у хлоропластов
2.2. Различные системы регуляции экспрессии генов биосинтеза аминокислот и аминоацилтРНК синтетаз у актинобактерий
2 3 Регуляция трансляции гътукоЕ АВС транспортера посредством
тиаминового рибопереключателя у актинобактерий
2.4. Регуляция трансляции гена аг0б с участием Тбокса у
цианобактерии АЬбюс РСС7
ГЛАВА 3. Моделирование классической аггенюаторной
регуляции биосинтеза триптофана у бакгерий
3.1. Математическая модель классической аггенюаторной регуляции
3.2 Проверка модели методом МонтеКарло
3.3. Тестирование модели и обсуждение результатов
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
- Київ+380960830922