Содержание
Введение.
Глава 1. Методики идентификации белков в смесях с применением массспектрометрии
Развитие применения массспектрометрии в протеомике
Подходы к идентификации белков методами массспектрометрии, существующие на данный момент
i ii.
Подход .
Подход
Секвенирование v
Метод точных массововременных меток.
Глава 2. Нормировка хроматографических времен удержания
Экспериментальное измерение времен удержания пептидов в хроматографической колонке.
Выравнивание времен хроматографического удержания между экспериментами, составляющими базу меток.
Расчет коэффициентов нормировки для экспериментов в базе данных меток
Случай отсутствия общего пептидного пересечения во всех экспериментах, занесенных в базу данных
Выравнивание времен хроматографического удержания между базой
данных и экспериментом без МСМС.
Наибольшая общая подпоследовательность
Поиск наибольшей общей подпоследовательности пиков в хроматомассспектрограммах.
Применение предлагаемого метода фильтрации данных по наибольшей общей подпоследовательности.
Поиск по базе точных массово временных меток
Схема оценки достоверности результатов поиска по базе меток
Глава 3. Способ построения изотопных распределений молекул, содержащих нецелое количество атомов.
Представление и расчет массспектра молекулы
Полиномиальное представление.
Представление в виде суммы дельта функций
Методика построения массспектров изотопных кластеров, основанная на преобразовании Фурье
Прямой расчет интенсивностей пиков изотопного кластера молекулы в случае нецелого числа атомов в ней
Расчет изотопных распределений для случаев нецелого числа атомов в молекуле, используя любой из существующих целочисленных методов построения изотопных распределений
Глава 4. База точных массововременных меток для протеома мочи человека
Объект исследования.
Методы исследования.
Сбор образцов мочи.
Подготовка проб для хроматомассспектрометрии.
Хроматомассспектрометрия.
Анализ данных и идентификация белков.
Структура базы данных.
Созданная база точных массововременных меток для протеома мочи человека
Аннотация белков по
Статистика измерений.
Список литературы
- Київ+380960830922