СОДЕРЖАНИЕ
Введение
Глава 1. Анализ современного состояния математического и программного
обеспечения информационного анализа биологических последовательностей
1.1. Статистический анализ и предсказание сайтов связывания рибосом.
1.2. Исследование сложности генетических текстов
1.3. Нахождение повторяющихся участков в последовательностях
1.3.1. Статистическая значимость повторов.
Глава 2. Реализация пакета прикладных программ для исследования структурной
организации последовательностей.
2.1. Интерфейс пользователя и типы входных данных.
2.2. Сервисные программы
2.2.1. Программа формирование по базе данных выборки участков
2.2.2. Программа 2 формирование по базе данных выборок участков
2.2.3. Программа генерирование псевдослучайной
последовательности
2.2.4. Программа подготовка заданного фрагмента
последовательности
2.3. Специальные программы для исследования серий последовательностей.
2.3.1. Программа 2 вычисление информационного содержания выборки
2.3.2. Программа выравнивание выборки участков
2.3.3. Программы I, I2 расчет статистик.
2.3.4. Программы X. X2, X3 расчет данных для электронных таблиц
2.3.5. Программы , 2, 3 расчет активности участков выборки.
2.3.6. Программы I, I расчет характеристик распределения значений функции, полученных на выборке.
2.3.7. Программа оценка качества расчета активностей выборок.
2.4. Программы обработки
2.4.1. Высоко и низкочастотная компоненты графа граммного
разложения
2.4.2. Программа расчет информационной избыточности текста
2.4.3. Программа алгоритмическая сложность текста
2.4.4. Программа I поиск неточных повторов.
2.4.5. Программа построение словаря последовательности.
Глава 3. Методика распознавания функциональных блоков на полных геномах.
3.1. Поиск общего сигнала в сериях участков биологических последовательностей
3.2. Равновесное состояние графа граммного разложения.
3.3. Выбор параметров скользящего окна и длины грамм
3.4. Какие особенности генетических последовательностей определяет новая информационная мера
Заключение
Библиография
- Київ+380960830922