Модели и алгоритмы обнаружения локальных закономерностей в задаче распознавания вторичной структуры белка

ОГЛАВЛЕНИЕ
0. Введение. О задачах распознавания в биоинформатике
0.1. Тема и актуальность исследования
0.2. О задачах распознавания в биоинформатике, начальных
данных и их экспериментальных источниках
0.3. Краткое содержание работы по главам
Глава 1. Разрешимость, регулярность и локальность задачи
распознавания вторичной структуры белка
1.1. Исходные определения
1.2. Локальность
1.3. Условие существования локальных функций
1.4. Разрешимость задачи и монотонность условия разрешимости
1.5. 0тупиковость и тупиковость систем масок
Глава 2. Анализ информативности мотивов на основе
критерия локальной разрешимости
2.1. Критерий разрешимости на объектах и мсгасловах
2.2. Монотонность условия разрешимости и тупиковые системы мотивов
2.3. Эвристические оценки информативности мотивов
2.4. Информативность мотивов и условие разрешимости
2.5. Об оценках информативности и непротиворечивых множествах объектов
Глава 3. Об использовании критериев локальной
разрешимости и регулярности для исследования морфологии первичной структуры белка
3.1. Локальная регулярность на множествах мотивов
3.2. Тупиковые множеств мотивов, обеспечивающие локальную регулярность
Глава 4. Построение оптимальных Валфавитов как
инструмент исследования морфологии вторичной структуры
4.1. Об алфавитах для описания вторичной структуры белка
4.2. Сложность Валфавита и критерий локальной разрешимости
4.3. Принцип максимального покрытия ведущих позиций
Глава 5. Экспериментальное тестирование формализма
5.1. Формирование непротиворечивых множеств объектов
5.2. Комбинаторное тестирование критерия локальной разрешимости
5.3. Комбинаторное тестирование критерия локальной регулярности
5.4. Построение оптимальных Всловарей
5.5. Эмпирическая схема распознавания вторичной структуры
6. Заключение
7. Список литературы
0. Введение. О задачах распознавания в биоинформатике
0.1. Тема и актуальность исследования
Темой исследования является разработка методов анализа данных на основе комбинаторного тестирования алгебраических критериев разрешимости и регулярности и применение указанных методов для решения проблемы отбора информативных локальных закономерностей в задаче распознавания вторичной структуры белка.
Актуальность