Содержание стр.
Сокращения
Введение .
Глава 1 Литературный обзор
1.1 Архитектура кофермеитсвязывающнх доменов АТРзависимых белков . . . . . .
1.1.1 Циклический АМРзависимая протеинкиназа .
1.1.2 0аланинПаланин лигаза
1.1.3 Гистидил тР Н Ксинтетаза . . . .
1.2 Пространственная укладка коферментсвязываюших доменов РЬРсодсржащих белков .
1.2.1 Аспартат аминотрансфераза
1.2.2 рСубъсдиница триптофан синтстазы . .
1.2.3 ПАминокислотная аминотрансфераза . .
1.2.4 Аланин рацемаза .
1.2.5 Гликоген фосфорилаза.
Глава 2 Методы сравнения пространственных структур. .
2.1 Сравнение топологий макромолекул расчетными методами .
2.1.1 Инициализация . . . . . .
2.1.2 Оценка эквивалентности структур .
2.1.3 Генетический алгоритм
2.1.4 Финальная суперпозиция структур алгоритм Керсли .
2.2 Графическое сравнение топологий макромолекул .
Глава 3 Структурное подобие коферментсвязываюших центров трех топологически различных семейств АГРзависисимых белков
3.1 Сравнение конформаций сАРК. и ЭОлигазы .
3.2 Эквивалентные суперпторичныс структуры, формирующие ЛТРсвязывающий центр сАРК и ОЭлига
3.3 Идентичность ключевых взаимодействий, определяющих положение и конформацию кофсрмсгта в структурах сАРК и ООлигазы .
3.4 Структурная комплементарность между коферментом и белком в АТРзависимых ферментах с различной третичной структурой . . . . .
Глава 4 Архитектура коферментсвязывающего центра в неродственных семействах РЬРзависимых белков . .
4.1 Сравнение третичных структур пяти РЬРсвязываю
щих доменов .
4.2 Роль эквивалентного структурного комплекса в формировании уникальных РЬРсвязывающих центров.
Выводы . . . . . . . . .
Литература
- Київ+380960830922