Математическое моделирование движения ионов в масс-спектрометрах

Введение
Глава 1. Математическая модель частиц в ячейке для моделирования поведения ионов в ловушке массспектрометра 1.1. Устройство и принцип работы массспектрометра на основе ионноциклотронного резонанса с фурьепреобразованием сигнала .
1.2. Математическая постановка задачи.
1.3. Алгоритм численного моделирования
1.3.1. Общая схема алгоритма.
1.3.2. Схема интегрирования уравнений движения.
1.3.3. Интерполяция заряда и поля
1.3.4. Численное решение уравнений поля
1.3.5. Метод детектирования сигнала ионноциклотронного резонанса
1.3.6. Алгоритм учета влияния нейтрального газа
1.4. Выводы.
Глава 2. Комплекс параллельных программ для моделирования экспериментов по измерению масс с помощью массспектрометра
2.1. Архитектура системы моделирования масстспектрометра .
2.2. Алгоритм распараллеливания кода частиц в ячейке
2.2.1. Параллельная реализация алгоритма моделирования
движения ионов в массспсктрометре .
2.2.2. Параллельная реализация алгоритма расчета кулонов
ского поля.
2.3. Исследование масштабируемости кода на системе . .
2.3.1. Исследование ускорения кода при увеличении числа процессоров.
2.3.2. Исследование эффективности кода при увеличении размера задачи и числа процессоров.7
2.4. Исследование масштабируемости на системе . .
2.4.1. Исследование масштабируемости в сильном смысле . .
2.4.2. Исследование масштабируемости в слабом смысле . 2.5. Выводы
Глава 3. Численное моделирование поведения ионов в ловушках массспектрометров
3.1. Исследование влияния кулоповских сил на массспектр
3.1.1. Исследование смещения спектральных пиков для ионов одной массы.
3.1.2. Исследование эффекта разрыва коалесценции ионных облаков с частицами двух близких масс
3.1.3. Поведение ионных облаков с частицами трех близких масс в реальной геометрии ловушки массспектрометра .
3.2. Исследование влияния напряженности магнитного поля на
эволюцию ионного облака в ловушке реальной геометрии. . . .1 3.3. Прямое сравнение результатов моделирования с экспериментом моделирование массспектра белка цитохром с
3.4. Исследование динамики ионного облака в накопительной
и транспортной линейных ионных ловушках.
3.5. Выводы.
Заключение
Список литературы