Рентгентоструктурное исследование эндонуклеазы из Serratia marcescens при разрешении 1.1 А

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
Глава I. Литературный обзор
1.1. Нуклеодеполимеразы классификация, функции
1.2. Объект исследования
1.2.1. Эндонуклеаза из ii источник, биохимические
характеристики, первичная последовательность
1.2.2. Семейство нуклеаз, гомологичных нуклеазе
1.2.3. Сайтнаправленный мутагенез нуклеазы
1.3. Магний как металл кофактор
1.4. 1 ространствешшя структура нуклеазы по литературным
данным
1.5. Пространственная структура спашфичсской нуклеазы Рро
по литературным данным
1.6. Уточнение атомных структу р
1.6.1. Традиционное уточнение
1.6.2. Максимизация правдоподобия
1.6.3 Стратегия максимизации правдоподобия
I.6.4. Связь традиционного и МПуточнения
Глава II. Кристаллизация и предварительное рентгеноструктурное
исследование эндонуклеазы
II.1. Получение и выделение трех изоформ эндонуклеазы
.2. Кристаллизация эндонуклеазы
.3. Предварительное рентгеноструктурное исследование
эндонуклеазы 5м
Глава III. Уточнение структуры нуклеазы Бт
.1. Уточнение структуры на разрешении 1.7 А
III.2. Уточнение структуры на разрешении 1.1 А.
Глава IV. Анализ структуры ну клеазы Бт
IV. 1. Сравнение положения атомов в структурах, уточненных
на 1.7 А и 1.1 А
У.2. Упаковка молекул в кристалле
У.2. Анализ карты Рамачандрана
У.З. Анализ элементов вторичной структуры
уточненной модели
IV.4. Описание активного центра
Глава V. Механизм действия нуклеазы Бт
ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ
Благодарности
ЛИТЕРАТУРА