ЗМІСТ
ПЕРЕЛІК УМОВНИХ
СКОРОЧЕНЬ
ВСТУП
РОЗДІЛ 1. ОГЛЯД
ЛІТЕРАТУРИ
1.1. Загальна характеристика плазмід……………………………
1.1.1. Кон’югативні та некон’югативні плазміди
1.1.2. Мегаплазміди та мініхромосоми бактерій……
1.1.3. Ітеронна та мішенева регуляція реплікації плазмід та групи
несумісності…………………………………………….
1.1.4. Характеристика окремих представників плазмід
1.1.4.1. ColE реплікон……….………………………….…… 1.1.4.2. Фаг-плазміда
P……….…………………….……………
1.1.4.3. Плазміда RP……….……………………………….……
1.1.4.4. Плазміда pKM…………………….……………………
1.1.4.5. Плазміда pTiC…………………….……………………
1.1.5. Плазміди і плазмідні профаги………………
1.2. Плазміди бактерій, асоційованих з рослинами
.
1.2.1. Плазміди фітопатогенних псевдомонад
.
1.2.2. Плазміди бактерій роду Agrobacterium………… …….
1.2.3. Плазміди бульбочкових бактерій роду Rhizobium
1.2.4. Плазміди бактерій родів Erwinia і Pantoea……………….
РОЗДІЛ 2. МАТЕРІАЛИ І МЕТОДИ
ДОСЛІДЖЕНЬ.
2.1. Штами бактерій і
бактеріофаги.
2.2. Поживні середовища, буферні розчини та хімічні
реактиви.
2.3. Методи
досліджень
2.3.1. Виділення плазмідної ДНК……………………………………….…
2.3.2. Виділення фагової ДНК………………………………………….….
2.3.3. Рестрикційний аналіз ДНК……………………………………….…
2.3.4. Електрофоретичне
розділення фагових та плазмідних ДНК…….
2.3.5. Встановлення фагочутливості штамів…………………………….
2.3.6. Одержання, концентрування фагових часток та визначення титру
бактеріофагів……………………………………………………………………
2.3.7. Електронно-мікроскопічне дослідження фагових часток ………
2.3.8. Одержання плазміди рСА::Tn …………………………………
2.3.9. Одержання штамів-дисоціантів ………………………………….…
2.3 Стерилізація та зберігання фагових лізатів…………………….
2.3 Електрофорез капсидних структур………………………………
2.3 Тест на патогенність………………………………………………
РОЗДІЛ 3. ЗАГАЛЬНА ХАРАКТЕРИСТИКА ПЛАЗМІД ERWINIA
CAROTOVORA…….
3.1. Особливості виділення плазмід E. carotovora………………….………
3.2. Розподіл плазмід E. carotovora за розміром………………………………
3.3. Відповідність між географічним походженням та утриманням плазмід штамів E.
carotovora .…………………………………………………….…
3.4. Чутливість до бактеріофагів………………………………………………
3.5. Зв'язок плазмідного спектра штамів E. carotovora з кілерною активністю
каротоворіцинів……………………………………………………….…………
3.6. Порівняння плазмідних профілів штамів E. coli. і Е. carotovora ………
3.7. Порівняння плазмідних профілів штамів Е. carotovora subsp. carotovora і Е.
carotovora subsp. atroseptica……………………………………….…………
РОЗДІЛ 4. ДОСЛІДЖЕННЯ МЕГАПЛАЗМІД ERWINIA CAROTOVORA ТА БАКТЕРІОФАГА
NF.
4.1. Дослідження мегаплазмід Е. carotovora
.
4.2. Рестрикційний аналіз мегаплазмід Е. carotovora…………………………
4.3. Бактеріофаг NF штаму Е. carotovora
А.
4.3.1. Отримання і дослідження фагових часток і нативної ДНК NF
4.3.2. Дослідження лізогенів Е. carotovora А, стійких до інфекції
бактеріофагом NF……………………………………………………………
4.4. Рестрикційний аналіз автономних генетичних елементів Е. carotovora
4.4.1.Порівняльний аналіз картин рестрикції геномів бактеріофагів NF і
ZF/……………………………………………………………………….
4.4.2. Порівняльний рестрикційний аналіз геномів мегаплазміди рСА- і
бактеріофага NF E. carotovora……….………………….…….
4.5. Дослідження причетності мегаплазміди рСА - до формування патогенності у
E. carotovora………………………………………………….
4.5.1. Штами-дисоціанти Е. carotovora А…………………….……….
4.5.2. Вивчення ступення патогенності штамів-дисоціантів Е. carotovora А на
бульбах картоплі ……………………………………….
4.5.3. Прояв патогенності Е. carotovora А на рослинах каланхое Дегремона
(Kalanchoe daigremontiana) …………………………………….
РОЗДІЛ 5. ВЛАСТИВОСТІ ПЛАЗМІДИ рСА ТА ЇЇ
ВАРІАНТІВ
5.1. Виявлення плазміди рСА та її
варіантів.
5.2. Рестрикційний аналіз плазміди рСА та її варіантів……………………
5.3. Рестрикційне картування плазміди рСА та її транспозоного варіанта
рСА::Tn9.
5.4. Дослідження делеційних варіантів плазміди рСА::Tn……………….
5.5. Дослідження плазміди рСА Е. carotovora А у клітинах
штамів-трансформантів E. coli DH……………………………………………………
РОЗДІЛ 6. АНАЛІЗ ТА УЗАГАЛЬНЕННЯ РЕЗУЛЬТАТІВ
ДОСЛІДЖЕНЬ.
ВИСНОВКИ.
СПИСОК
- Київ+380960830922